Axe 1 : Caractérisation des pathosystèmes et épisystèmes au niveau de l’organisme/individu et de la population

 Les questions de recherche abordées par l'Axe 1 visent à:

• Caractériser la diversité des pathogènes, vecteurs et hôtes ainsi que leurs interactions afin d’analyser les processus pathologiques
• Comprendre les mécanismes évolutifs du génome des pathogènes
• Étudier la distribution et la structuration des populations de pathogènes, d’hôtes ou de vecteurs
• Étudier les communautés de microorganismes présents au sein des vecteurs et quantifier la capacité vectorielle des couples vecteurs-pathogènes

Axe 2: Intégration des organismes et populations dans le socio-écosystème

Les travaux de l'Axe 2 ont pour objectif:

• Analyser les déterminants des interactions  (influence de l’homme et de l’environnement sur les interactions hôtes - vecteurs – pathogènes, modèles de dynamique de transmission incluant mobilité et contacts à des échelles locales ou régionales)
• Analyse et modéliser les risques sanitaires en intégrant les facteurs liés à la biodiversité, l’écologie et la géographie (interactions faune sauvage-domestique, interactions entre la gestion des ressources naturelle et l’occurrence des maladies)
• Analyser l’environnement au sens large (agriculture, biodiversité, économie, politiques sanitaires) et ses impacts sur la santé

Axe 3 : Surveillance et contrôle des maladies, gestion de la santé

L’axe 3 est organisé autour de questions plus opérationnelles, pour améliorer la surveillance et le contrôle des maladies et la gestion de la santé:

• Développer l'innovation en matière d'outils biotechnologiques et de diagnostic: nouveaux vaccins et tests diagnostiques, thérapeutiques innovantes, diminution de l’utilisation des insecticides et antibiotiques et de l’apparition de résistances, amélioration des techniques de lutte antivectorielle

• Optimiser les stratégies de surveillance et contrôle: approches participatives, lutte intégrée, approches transdisciplinaires, transfert des résultats de la recherche

• Evaluer les systèmes de surveillance et mesures de contrôle des maladies et mesurer leur impact: efficacité de la vaccination, évaluation épidémiologique et économique ex ante et ex post

• Améliorer la gouvernance pour la surveillance et le contrôle en santé: bénéfices de l'action collective, des approches régionales, des liens public-privés